金屬硫蛋白基因的分子進(jìn)化分析論文提綱
論文摘要: 金屬硫蛋白(metallothionein,MT)是一種具有重要生物學(xué)功能的蛋白質(zhì).迄今為止,發(fā)現(xiàn)并確定了氨基酸(略)蛋白超過200種.金屬硫蛋白一般由61~68個氨基酸組成,含有保守的20個半胱氨酸殘(略)地結(jié)合銅鋅等重金屬,具有維持微量元素的代謝平衡、重金屬解毒、影響細(xì)胞的增殖與凋亡、清除自由基及參與應(yīng)激反應(yīng)等重要的生物學(xué)功能. 金屬硫蛋白的編碼序列及氨基酸序列包含了大量的生物信息.傳統(tǒng)(略)中于金屬硫蛋白的結(jié)構(gòu)和功能,而忽略了對其結(jié)構(gòu)和功能起決定作用的基因序列、代謝途徑和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等的研究.這些序列中含有大量的生物信息,從中挖掘出重要的生物知識,有利于為金屬硫蛋白的深入研究提供參考和指導(dǎo). 本研究從金屬硫蛋白的數(shù)據(jù)庫中搜集其編碼序列及氨基酸序列,利用貝葉斯方法構(gòu)建其系統(tǒng)發(fā)育樹.同時根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育樹(略)白基因劃分為五個亞家族,對每個亞家族進(jìn)行氨基酸使用頻率統(tǒng)計以及選(略)指出了在進(jìn)化中較保守的對其功能有重要作用的氨基酸位點以及各亞家族在進(jìn)化過程中受到的選擇作用. 本研究同時搜集了哺乳動物的金屬硫蛋白基因及氨基酸序列,利用鄰接法構(gòu)建了哺乳動物金屬...
Meta(omitted)n is a protein with(omitted) biologic(omitted)ns, called MT for abbreviation. So far, the amino acid sequences of metallothionein discovered and identified are more than 200. Metallothioneins are g(omitted)omposed of 61-68 amino acids in length, contain 20 conserved cysteine residues, and can be effectively combined with zinc and other heavy metals, with i(omitted)iological functions, including maintaining metabolic balance, heavy metal detoxification, cell proliferation and apoptosi...
目錄:中文摘要 第8-9頁
英文摘要 第9-10頁
1 引言 第11-27頁
·金屬硫蛋白的研究 第11-18頁
·金屬硫蛋白的結(jié)構(gòu)與分類 第11-13頁
·金屬硫蛋白的基因結(jié)構(gòu)及調(diào)控 第13-15頁
·金屬硫蛋白的功能 第15-17頁
·金屬硫蛋白的應(yīng)用 第17-18頁
·分子進(jìn)化分析研究 第18-26頁
·生物信息學(xué)的發(fā)展 第18-19頁
·系統(tǒng)發(fā)育分析 第19-23頁
·蛋白質(zhì)的中性與適應(yīng)性進(jìn)化 第23頁
·基于系統(tǒng)發(fā)育樹的似然法檢驗自然選擇作用 第23-25頁
·利用功能分歧系數(shù)檢驗自然選擇作用 第25-26頁
·研究的目的與意義 第26-27頁
2 材料與方法 第27-29頁
·實驗一序列 第27頁
·實驗一方法 第27-28頁
·序列比對與系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建 第27頁
·選擇壓力分析 第27-28頁
·實驗二序列 第28頁
·實驗二方法 第28-29頁
·序列比對與系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建 第28頁
·選擇壓力分析 第28頁
·功能分歧分析 第28-29頁
3 結(jié)果與分析 第29-42頁
·實驗一分析結(jié)果 第29-36頁
·實驗序列選取 第29頁
·系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建 第29-32頁
·選擇壓力分析 第32-36頁
·實驗二分析結(jié)果 第36-42頁
·實驗序列選取 第36頁
·系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建 第36-39頁
·選擇壓力分析 第39-40頁
·功能分歧分析 第40-42頁
4 討論 第42-44頁
·實驗一系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建 第42頁
·實驗一選擇壓力分析 第42頁
·實驗二系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建 第42-43頁
·實驗二選擇壓力分析與功能分歧分析 第43-44頁
5 結(jié)論 第44-45頁
致謝 第45-46頁
參考文獻(xiàn) 第46-51頁
附錄 第51-55頁
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文 第55頁
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