食品衛(wèi)生檢驗(yàn)中沙門菌屬LAMP檢測方法的應(yīng)用效果分析
Loop-mediated isothermal amplification 縮寫為LAMP, 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(Loop-mediated isothermal amplification method,LAMP)是一門新興的基因擴(kuò)增技術(shù),作為一種分子生物學(xué)檢測技術(shù),具有高特異性、高敏感性、簡單、便捷及成本低的特點(diǎn),已廣泛用于臨床疾病的診斷、流行性細(xì)菌或病毒的定性定量檢測、動物胚胎性別鑒定及基因芯片開發(fā)等領(lǐng)域。
摘要:目的:分析沙門菌屬LAMP在食品衛(wèi)生檢驗(yàn)中的應(yīng)用效果。方法:擇取2015年2月-11月的食品標(biāo)本142份,通過LAMP以及分離培養(yǎng)法對其進(jìn)行檢測與鑒定,對比兩組檢測結(jié)果。結(jié)果:通過LAMP檢測所得結(jié)果中,陽性率顯著優(yōu)于分類培養(yǎng)鑒定結(jié)果,數(shù)據(jù)差異存在統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0、05);應(yīng)用LAMP進(jìn)行檢驗(yàn),可以通過加熒光染料染色法判斷結(jié)果;LAMP檢測時(shí)間不超過24h,而分離培養(yǎng)鑒定時(shí)間在4d-7d左右。結(jié)論:應(yīng)用LAMP法對食品進(jìn)行檢測,不僅具有較高的沙門菌屬陽性率,而且檢測周期較短,實(shí)際應(yīng)用價(jià)值顯著,值得廣泛推廣。
關(guān)鍵詞:食品衛(wèi)生檢驗(yàn) LAMP檢測方法 應(yīng)用效果 沙門菌屬
沙門菌是誘發(fā)人體種類細(xì)菌性食物中毒的主要因素。現(xiàn)階段,檢測沙門菌的主要方法為分類培養(yǎng)法,該方法雖然具有較好的準(zhǔn)確性,但操作程序十分繁瑣,免疫學(xué)法并不具較好的敏感度,而PCR雖然具有較高的敏感度以及特異度,但在設(shè)備方面具有較高的要求,推廣限制較大。LAMP屬于新興核酸擴(kuò)增法,具有特異性強(qiáng)、快速以及簡單等優(yōu)勢。本次試驗(yàn)主要通過對比分析分類培養(yǎng)法與LAMP法在食品沙門菌屬方面的檢測效果,進(jìn)而探析LAMP法的應(yīng)用價(jià)值。
一、資料與方法
1、一般資料
擇取2015年2月-11月的食品標(biāo)本142份,其中,有6分生食類蔬菜、8份鮮榨果汁、8份沙拉、10份冰激凌、10份生水產(chǎn)品、20份速凍米面、20份非發(fā)酵豆制品、20份熟肉、20份生鮮肉以及20份冷凍生肉。以腸炎沙門菌為參考菌株。
2、檢測方法
取25g食品標(biāo)本置于無菌均質(zhì)袋內(nèi),以拍擊式均質(zhì)器進(jìn)行拍打,2min后停止,將其置于37℃環(huán)境中培養(yǎng)10h,冷凍食品置于45℃環(huán)境中解凍15min。
對標(biāo)本行分離培養(yǎng)法檢測:在10mlTTB增菌液中接種1ml增菌后標(biāo)本,然后置于42℃中對其進(jìn)行培養(yǎng),時(shí)長為24h。另在101mlSC增菌液中接種1ml增菌后標(biāo)本,在37℃環(huán)境中培養(yǎng)4h。各取1杯增菌液,分別進(jìn)行XLD平板與BS平板接種,于37℃環(huán)境中培養(yǎng)24h。擇取3個(gè)可疑菌落,進(jìn)行賴氨酸脫羧酶試驗(yàn)培養(yǎng)基、營養(yǎng)瓊脂平板以及TSI接種,于37℃環(huán)境中培養(yǎng)24h。如果生化反應(yīng)與沙門菌特征相符,取出營養(yǎng)瓊脂平板中的可疑菌落,通過生理鹽水,配制為菌懸液,然后通過微生物鑒定系統(tǒng)進(jìn)行分析。如果XLD平板、BS平板中不存在可疑菌落,繼續(xù)將BS平板置于37℃環(huán)境中培養(yǎng)24h,如檢測仍不存在可疑菌落,則為陰性。
對標(biāo)本進(jìn)行LAMP檢測:取1ml標(biāo)本前增菌液,對其進(jìn)行離心處理,離心率為每分鐘10000r,共2min,排除上清提取核酸;另取上清液1l,制成DNA待檢模板,對食品標(biāo)本進(jìn)行DNA檢測,反應(yīng)后,通過肉眼觀察反應(yīng)液顏色,如果呈現(xiàn)綠色,則為陽性;如果呈棕色,或是無色,則為陰性。
3、觀察指標(biāo)
觀察兩種檢測方法的陽性率。
4、統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
本次實(shí)驗(yàn)過程中,以SPSS19、0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件對兩種檢測方法所涉及數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。其中計(jì)數(shù)的資料用n(%)表示,數(shù)據(jù)的組間比較以χ2進(jìn)行檢驗(yàn);計(jì)量資料用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(χ±s)表示,數(shù)據(jù)的.組間比較以T進(jìn)行檢驗(yàn),P<0、05為統(tǒng)計(jì)學(xué)差異顯著的判定標(biāo)準(zhǔn)。
二、結(jié)果
LAMP檢測方法的陽性率為11、27%,分離培養(yǎng)法的陽性率為4、23%,數(shù)據(jù)組間比較差異明顯,即P<0、05,詳情見表1:
三、討論
由各種類型沙門菌引發(fā)不同形式的野生禽獸、家畜以及人體感染,被統(tǒng)稱為沙門菌病。帶菌者,或是感染沙門菌人的糞便會在一定程度上污染食物,導(dǎo)致人體食物中毒。沙門菌極易導(dǎo)致人體發(fā)生細(xì)菌性食物中毒,主要表現(xiàn)有敗血癥、腸胃炎以及腸傷寒等,而且具有一定的傳染性,可以通過消化道致病。LAMP檢測法是新興恒溫核酸擴(kuò)增法,根據(jù)靶基因所具有的6個(gè)區(qū)域,設(shè)計(jì)出來4種特異引物,通過特定鏈對DNA聚合酶進(jìn)行置換處理,然后將其置于恒溫條件下45min左右,促使其產(chǎn)生擴(kuò)增反應(yīng)。相對比PCR而言,LAMP在模板方面并不存在紫外觀察、電泳、溫度循環(huán)以及熱變性等要求,不僅簡單快捷,具有非常強(qiáng)的特異性,而且檢測范圍相對較大,檢測靈敏度較好,在實(shí)際應(yīng)用過程中,不需要借助特定儀器設(shè)備,便可以實(shí)現(xiàn)現(xiàn)場快捷且高通量檢測,成本較低,經(jīng)濟(jì)性能顯著。
細(xì)菌分離培養(yǎng)法操作程序較為復(fù)雜,檢測速度比較緩慢,基本上,需要檢測7d后,才能獲取陽性結(jié)果,而且分離細(xì)菌后,還要UI器進(jìn)行增菌與再分離培養(yǎng),生化鑒定過程中繁瑣,且成本較高,難以實(shí)現(xiàn)普及。LAMP可以直接提取前增菌液內(nèi)的核酸,60min中便可以完成對其的擴(kuò)增操作,沙門菌屬檢出時(shí)間不會超過24h,效率非常高。不僅如此,應(yīng)用該方法可以通過肉眼直接觀察檢測結(jié)果,具有非常顯著的直觀價(jià)值與便捷性。
通過本次實(shí)驗(yàn)可知,LAMP檢測法與分離培養(yǎng)法檢測結(jié)果的陽性率差異非常顯著,LAMP檢測陽性率為11、27%,分離培養(yǎng)法檢測的陽性率為4、23%,數(shù)據(jù)比較P<0、05,統(tǒng)計(jì)學(xué)意義顯著。
四、結(jié)語
應(yīng)用LAMP法對食品進(jìn)行檢測,不僅具有較高的沙門菌屬陽性率,而且檢測周期較短,實(shí)際應(yīng)用價(jià)值顯著,值得廣泛推廣。
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